Почти двести лет на территории Керчи и ее окрестностей ученые ведут археологические раскопки (планомерные раскопки в Керчи начались с 30-х годов XIX века.). История города — древняя. Многое из найденных памятников материальной культуры стало экспонатами крупнейших музеев страны.
Немало реликвий седой старины сохраняется и в Керченском историко-археологическом музее. В церкви Иоанна Предтечи (конец IX в.) есть большое хранилище лапидарнее — камней с надписями. Это своеобразный архив города. Он кратко рассказывает о киммерийцах и скифах, о греческом поселении Пантикапее и о когда-то могущественном Боспорском рабовладельческом царстве, о «городе кузнецов» Корчеве, о колонии генуэзских купцов Черкио.
Нынешняя территория города Керчи была заселена ещё в доисторический период. Первые находки среднего палеолита выявил археолог Н.Д.Праслов в 1966 г. у основания мыса Кара-Бурун, на котором расположено античное городище Нимфей, и вблизи Тобечикского озера. Краевед Б.И. Бабич в 2000 г. нашёл в урочище Кезы отщеп леваллуазского облика. А.И. Мельник в 2009 году выявил пункт Камыш-Бурун с находками мустьерского периода. На Эспланадной улице в Керчи найдены зубы мамонта. Возраст находок 100 – 40 тысяч лет назад.Эти находки – свидетельство обитания неандертальцев на Керченском полуострове.
Более многочисленны стоянки, местонахождения и пункты мезолита (8000 – 5000 лет до н.э.) и неолита (5000 – 4000 лет до н.э.) на Керченском полуострове. Их открыли А.Д. Архангельский, С.И. Забнин, П.Н. Заболоцкий, А.А.Щепинский, Ю.Г.Колосов, Л.Г.Мацкевой, В.В. Вахонеев, С.А.Шестаков. Теперь в Восточном Крыму выявлено 60 памятников этого времени. Жители занимались охотой и рыболовством. На территории Керчи находится пункты Митридат I, Мыс Карантинный, Керчав-Илгасы, Александровка, Героевское I, Эльтиген I, Эльтиген II.
От эпохи бронзы (III – I тысячелетия до н.э.) на Керченском полуострове остались курганы с погребениями ямной, кеми-обинской, катакомбной и срубной археологических культур и поселения скотоводов и земледельцев. Эти памятники открыли и исследовали В.В. Веселов, И.Т.Кругликова, А.М. Лесков, В.Г. Збенович, В.Д. Рыбалова, С.С. Бессонова, А.Е. Кислый. На землях города Керчи находятся поселения каменской культуры: эпонимное поселение Каменка, Глейки, Маяк I, Маяк II.
Ранний железный век представлен кизил-кобинской культурой (Х – V вв. до н.э.), население которой и встретило греческую колонизацию Северного Причерноморья. Курган этой культуры исследовала С.С.Бессонова, керамика встречается на некоторых античных городищах.
Остатки крепостных валов, курганов, склепы и катакомбы раскрывают перед исследователями тайны веков.
В черте города находятся несколько курганов — погребальных сооружений под высокой искусственной насыпью. Керчь включена в международную программу ЮНЕСКО «Шелковый путь»
Не раз завоеватели превращали Керчь в пепел и руины, но город, словно сказочный феникс, возрождался к жизни, становился еще красивее и богаче. Яркое подтверждение тому — сегодняшний день города-героя, города-солдата.